Директор попросил меня взять на себя обязанности ушедшего на больничный руководителя. А теперь не хочет доплачивать, так как я не являюсь заместителем заболевшего.

По статье 15 Трудового Кодекса РФ работнику, выполняющему дополнительную работу без освобождения от основной, производится доплата за совмещение профессий (должностей) вне зависимости от того, является ли работник штатным заместителем временно отсутствующего работника.